Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CENPAP49450 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPAP49450 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPAP49450 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms