Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTNNB1P35222 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms