Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OTX2P32243 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTX2P32243 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTX2P32243 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms