Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD10P28358 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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