Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CTSSP25774 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CTSSP25774 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTSSP25774 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms