Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTAFRP25105 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms