Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPRZ1P23471 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
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