Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD53P19397 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD53P19397 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD53P19397 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD53P19397 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD53P19397 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD53P19397 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD53P19397 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD53P19397 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms