Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFTPCP11686 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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