Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRCP08575 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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