Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLIN1O60240 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLIN1O60240 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms