Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E9PBE3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E9PBE3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E9PBE3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E9PBE3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms