Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NEMP2A6NFY4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms