Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC78A2IDD5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC78A2IDD5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms