Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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HCN4Q9Y3Q4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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HCN4Q9Y3Q4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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HCN4Q9Y3Q4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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HCN4Q9Y3Q4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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HCN4Q9Y3Q4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HCN4Q9Y3Q4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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