Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR1DQ9Y2S0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms