Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTF2Q9UNY4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms