Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PEMTQ9UBM1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms