Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EMILIN3Q9NT22 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms