Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR1EQ9GZS1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms