Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
RNF17Q9BXT8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF17Q9BXT8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms