Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R3Q9BXE9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms