Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
REPIN1Q9BWE0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms