Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms