Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA3Q99758 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA3Q99758 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA3Q99758 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA3Q99758 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCA3Q99758 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCA3Q99758 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCA3Q99758 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCA3Q99758 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCA3Q99758 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms