Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIN3AQ96ST3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIN3AQ96ST3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms