Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YTHDC1Q96MU7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms