Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EP400Q96L91 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms