Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM71F1Q96KD3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms