Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC136Q96JN2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms