Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNPDA2Q8TDQ7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms