Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CMTM1Q8IZ96 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms