Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stk40Q7TNL3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stk40Q7TNL3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms