Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
STRADAQ7RTN6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms