Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAXIP1Q6ZW49 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAXIP1Q6ZW49 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms