Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC73Q6ZRK6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms