Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LIAT1Q6ZQX7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LIAT1Q6ZQX7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms