Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Msi1Q61474 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms