Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC12

ATPAF1, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF1Q5TC12 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATPAF1Q5TC12 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms