Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL24A1Q17RW2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL24A1Q17RW2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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