Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCBQ16585 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCBQ16585 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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