Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC1A5Q15758 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC1A5Q15758 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms