Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SYCP1Q15431 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SYCP1Q15431 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SYCP1Q15431 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SYCP1Q15431 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SYCP1Q15431 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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