Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BRD3Q15059 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms