Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCINQ13939 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCINQ13939 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCINQ13939 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCINQ13939 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCINQ13939 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCINQ13939 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCINQ13939 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCINQ13939 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCINQ13939 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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CCINQ13939 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCINQ13939 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCINQ13939 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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