Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE4DQ08499 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE4DQ08499 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms