Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms