Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK17Q00537 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK17Q00537 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms