Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBA52P62987 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms