Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTPAP49638 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTPAP49638 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTPAP49638 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTPAP49638 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTPAP49638 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TTPAP49638 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTPAP49638 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTPAP49638 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTPAP49638 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTPAP49638 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TTPAP49638 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
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TTPAP49638 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TTPAP49638 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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